科学家通过梦幻的睫毛化石复制出的超梦，在被小智与皮卡丘的“友情”暂时安抚后，沉入了深海休眠。但新的威胁降临——一支名为“起源基金会”的神秘组织从海底打捞出超梦的休眠舱，并用更激进的技术解除了它自我封印的记忆。超梦发现自己不仅有梦幻的基因，还被意外注入了另一只古代传说中的宝可梦“基拉祈”的许愿碎片。它开始分裂出三个不同的人格：复仇者、守护者与虚无者。三方人格在超梦体内发起内战，现实世界开始以超梦为中心发生“逆梦”——人和宝可梦的愿望全部反转，想变强的人变得懦弱，想回家的人永远在原地打转。小智必须进入超梦的意识海，同时面对三个超梦的质问：如果我是被许愿而生，那许愿的人是否要对我负责？最终小智没有用拳头而是用一个问题结束了战争：“你许过愿吗？不是为你自己。”
3D重制版在技术上绝对炸裂，超梦的意识海场景堪称当代动画的视觉奇观。最大的惊喜是剧本没有炒1998年的冷饭，而是把“克隆伦理”升级到了“造物主与被造物的双向许愿”。三个超梦的人格分裂设定让动作戏变成哲学辩论，而小智最后那个反问把整部电影从“谁是主人”拉回到了“谁在需要”。皮卡丘戏份很少但每次出场都是泪点。
韩国
国王因初恋去世而颁布“禁婚令”，全国单身贵族炸锅，一名女骗子胆大包天，敢来“承包”国王的婚事。
中国大陆
米小圈升入四年级，遇到一位会打快板的新语文老师，课堂变成“相声专场”。
中国香港
卧底警察入狱接近黑帮老大，却在三年里真的把他当成了大哥。
美国
四名探险家进入未被记录的峡谷裂缝，发现底部栖息着视声音为猎物的远古盲兽。
中国香港
分手七年的情侣，在一辆翻新的小巴上重逢，他们决定把车开回分手那一天。
德国
在一个通过基因编辑剔除所有负面情绪的未来社会，那些“残留”了悲伤能力的人，被视为精神病。
中国大陆
这一次，孙悟空没有被压五行山，而是被改造成天庭的“斗战胜佛”AI，每年下凡“清除”一次反抗者。
中国大陆
1895年乙未战争，秀才吴汤兴拉起三千义军对抗日军，弹尽粮绝时用一座空城唱了一出“空城计”。